Модернизацията на жп отсечката Септември – Пазарджик е съставена от три участъка, обособени в три позиции. Според генералния директор на НКЖИ Милчо Ламбрев предстои внасянето на проекта в министерството на регионалното развитие и през септември се очакват разрешенията за строеж по позиции. Вече са доставени релси и траверси, изградени са приобектови офиси и е осигурена голямата част от механизацията.Поради разнородните проблеми при тръжната процедура за избор на строителен надзор дейностите по строителните договори започнаха много по-късно и това е първоначалната причина за забавянето на проекта. Затова изпълнителите на трите позиции са подали искове със значителни финансови претенции към бенефициента.Проектът е определен от управляващия орган като високорисков и по него, както и по Първомай - Свиленград, от септември започват ежемесечни проверки.Позиция 1 е от км 102+014 и западната гърловина на гара Септември до км 119+692 при гърловината на гара Пазарджик и гарите Септември и Пазарджик,  с разгъната дължина 35.22 км. Изпълнители са консорциум "Свиетелски – РВП Кьоне", съставен от "Свиетелски" - Австрия, и "Ремонтно-възстановително предприятие"Кьоне". Началото на строителството е 5 декември 2012 г., а крайният срок за завършване е 4 февруари 2015 г., или време за изграждане 26 месеца. Стойността на обекта е 75 350 325 лв. с ДДС.Позиция 2 е за модернизация на жп отсечката Пазаржик – Стамболийски от км 119+624 на източната гърловина на гара Пазарджик до км 138+755, включително и гарите Огняново и Стамболийски. Разгънатата й дължина е 38.24 км. Изпълнители са ДЗЗД "Ай Джи Ей жп инфраструктура", съставено от "ГЕА 21", Испания, "Инжстройинженеринг", България, и "Конструксионес Аранас Асинас", Испания. Началото на строителството е 5 декември 2012 г., обектът следва да бъде завършен до 5 май 2015 г., или за 29 месеца. Стойността на обекта е 65 792 522 лв. с ДДС.Позиция 3 е за модернизация на жп отсечката Стамболийски – Пловдив с разгъната дължина 31.6 км. Началото е при км 138+755 (западна гърловина на гара Стамболийски) до км 156+606 на западната гърловина на гара Пловдив, включително и гара Тодор Каблешков. Изпълнител е "Порр Бау", Австрия. Началото на строителството е 5 декември 2012 г., а крайният срок за завършване е 5 юни 2015 г., или 30 месеца. Стойността на проекта е 64 233 454 лв. с ДДС.Гара Пазарджик е част от друг проект по ОП "Транспорт", в който попадат и приемните здания  в София и Бургас. Обжалването на търга е приключило - жалбата е оттеглена. Предстои подписване на договори за строителство и строителен надзор.