От Държавния културен институт - Културен център "Двореца" в Балчик към Министерството на културата, обвиняват Софийския университет в безстопанственост и липса на научна продукция по отношение стопанисването на ботаническата градина. В съобщение до БТА от института посочват, че с особена острота звучи въп­росът за безотчетно похарчените пари, които Министерството на културата е превеждало на Софийския университет преди прекратяване на споразумението между двете институции през юни 2003 г. След неговото прекратяване университетската ботаническа градина започва да събира пари на отделна каса, чиято законност е оспорвана в съда. За периода от началото на 2002 г. до юли 2003 г. Министерството на културата превежда на университетската ботаническа градина - Балчик, респективно на Софийския университет общо 203 584 лева. След като университетската ботаническа градина поставя своя отделна каса, за размера на събираните от нея суми съдим по приходите от продажбата на билети на касата на "Двореца", тъй като всички посетители плащат по два билета с еднаква цена на всяка от двете каси, се посочва още в съобщението.